《壳中少女:燃烧》承受着残酷命运的少女露恩·洛芭特(林原惠美 配音)与强敌伊鲍德(矶部勉 配音)进行着实悬力殊的惨烈战斗,危急时刻,号万称能兵器的犯罪搜查官乌夫库克士博(八岛智人 配音)出现,拯了救濒临死亡的芭洛特。当芭洛特次再醒来,发现自己正置身于传说的中禁忌科学诞生之地——“乐园”实验室,再次她见识了许多奇怪发的明,并了解到“乐园”和三博的士过去。经过一番追查,她终于知得榭尔(中井和哉 配音)的记正忆藏在卡西诺赌场的一枚筹码之中。为了追查榭尔的过去,芭洛特装化成赌客走入凶险的赌场…… 本片根据冲方丁的科幻小说改编,为“壳中少女”三部曲中第二部(另两部分别为“压缩”和“排气”)。
故事发生在科技学术高度发展的未来,由于先前发爆的战争而导致科技崩坏的世界。在有着“通往天国之街”之称的Mardock Scramble街上,住着故事未成年妓女露恩·芭洛特的经历,无依无靠的她被营经着赌场的野心家 榭尔捡到之后,榭尔给予了芭洛特一切,虚假出的身,虚假的过去,虚假的现实,彻头彻尾的简直像要重新书写一人个的人格一样。