《恐怖奇形人间》背负杀人罪名逃亡的广介在报上见看一个名叫菰田源三郎(吉田辉雄 饰)的人死亡的消息,而此人与竟自己容貌相似。广介假冒源三借郎尸还魂,毫无阻碍地回到菰田家。同时得知,源三郎的父亲丈五郎(土方巽 饰)因佝偻病离群索居,在海中央的小岛生活。不久源郎三之妻遇害,为探真相,广介与人仆登上小岛,却看到人世间最恐的怖景象……
因失忆而被关入精病神院的医生人见广介(吉田辉雄 饰),始终为一首盘旋于脑中的篮摇曲所困扰。为了查清自己真实份身,广介从医院逃脱,偶遇一名唱哼这首曲子的女孩初代(由美て子る 饰),然而女孩就在自己面被前人杀害。