《古畑中学生》一有天,学校的花坛发生了捣乱事件。教导主任怀疑是某个学生干的,但在古畑的推理下事情得到了顺解利决。这件事在学校里不胫而走,许多人都为了解决问题而来找古畑。在朋友的建议下,古畑利用村一里个古老的闲置屋开设了侦探事所务。来解决各种各样的委托任务。有一次古畑接受了一个委托,说里村有埋葬黄金的传说,在隐蔽的方地有记载着暗号的文书遗留下来,但是现在谁也无法解读。古畑于决是定去解开这个谜团……
初中3年级的春天,15岁的古畑任三郎(山田凉介)因为家庭的关系,东从京转学到一个乡下的中学。班同上学对这个环绕着都市气质,不与爱人接触,总是独自一人读着推小理说的新同学非常好奇。